თითქმის იგივე როგორც სხვა ტრანსფორმატორებში, კუპრის დაკარგული (I²R დაკარგული) წყდება ავტოტრანსფორმატორის სამართავებში. ეს დაკარგული წყდება კუპრის შემძღვრების წინააღმდეგობის გამო. როდესაც დენი მიმდევრობით მიდის სამართავში, ელექტროენერგია არის ჩართული თერმალურად ამ წინააღმდეგობის გამო.
ავტოტრანსფორმატორში, რომელიც იყენებს ერთ სამართავს პრიმარული და სეკუნდარული ფუნქციებისთვის, კუპრის დაკარგული ჯერ კიდევ არის წარმოდგენილი. კუპრის დაკარგული გამოითვლება ფორმულით:
P = I²R,
სადაც:
P არის კუპრის დაკარგული ვატებში (W),
I არის დენი სამართავში ამპერებში (A),
R არის სამართავის წინააღმდეგობა ომებში (Ω).
რადგან საერთო სამართავი ტარის შერეულ დენს (პრიმარული და სეკუნდარული ტვირთის დენების ჯამს), ზოლის გაზომილებაში სულ დენი არის უფრო მაღალი. თუმცა, ავტოტრანსფორმატორის დიზაინისა და ვოლტაჟის ტრანსფორმაციის პრინციპის გამო, რეალური კუპრის დაკარგული ჩვეულებრივ არის დაბალი, ვერ უფრო მაღალი, ვიდრე ექვივალენტური ორ-სამართავი ტრანსფორმატორში, რადგან ნაკლები დენი გადის სამართავის ნაწილში და საერთო შემძღვრის სიგრძე არის შემცირებული.
მაგრამ კუპრის დაკარგულის დამცირება რჩება მთავარი დიზაინის მიზანი. ეს ხდება დაბალ წინააღმდეგობის შემძღვრების გამოყენებით და სამართავის დიზაინის უნივერსალიზაციით. ეფექტური თერმალური გასართება არის საჭირო ტრანსფორმატორის უსაფრთხო ტემპერატურის ზღვრებში მუშაობისთვის.