Kupra perdido, ankaŭ konata kiel I²R-perdo, okazas en la spiro de aŭtotransformilo same kiel ĉe aliaj tipoj de transformiloj. Tiu perdo aperas pro la rezisteco de la kupraj konduktoroj en la spiroj. Kiam kuranta fluaĵo tra la spiro, elektra energio estas konvertita en varmo pro tiu rezisteco.
En aŭtotransformilo, kiu uzas ununuran spiron por ambaŭ primara kaj sekundara funkcioj, kupra perdado ankoraŭ ekzistas. La kupra perdado kalkuliĝas per la formulo:
P = I²R,
kie:
P estas la kupra perdado en vatonoj (W),
I estas la kuranta fluaĵo tra la spiro en amperoj (A),
R estas la rezisteco de la spiro en ohmoj (Ω).
Ĉar la komuna spiro portas la kombinitan kurantan fluaĵon (la sumon de la primara kaj sekundara ŝargaj kurantoj), la tuta kuranta fluaĵo en la kunhavata sekcio estas pli alta. Tamen, pro la disegno de la aŭtotransformilo kaj la principo de tensio-transformado, la efektiva kupra perdado kutime estas pli malalta ol tiu en ekvivalenta du-spira transformilo, ne pli alta, ĉar malpli da kuranta fluaĵo fluas tra parto de la spiro kaj la tuta konduktora longo estas reduktita.
Tamen, minimumigi la kupran perdadon restas grava celo de disegno. Tio atingiĝas per uzo de malaltrezistancaj konduktoroj kaj optimumigo de la spira disegno. Efektiva varm-dissipado estas esenca por certigi ke la transformilo operacias en sekuraj temperaturaj limoj.