วิธีที่การสูญเสียจากทองแดงมีผลต่อประสิทธิภาพของอัตตาลักษณะและวิธีลดผลกระทบนั้น

การสูญเสียจากทองแดง หรือที่เรียกว่า การสูญเสีย I²R เกิดขึ้นในขดลวดของออโต้ทรานส์ฟอร์มเมอร์เช่นเดียวกับทรานส์ฟอร์มเมอร์ประเภทอื่น ๆ การสูญเสียนี้เกิดจากความต้านทานของสายนำทองแดงในขดลวด เมื่อมีกระแสรันผ่านขดลวด พลังงานไฟฟ้าจะถูกเปลี่ยนเป็นความร้อนเนื่องจากความต้านทานนี้

ในออโต้ทรานส์ฟอร์มเมอร์ ซึ่งใช้ขดลวดเดียวสำหรับทั้งฟังก์ชันหลักและรอง การสูญเสียจากทองแดงยังคงมีอยู่ การสูญเสียจากทองแดงคำนวณโดยใช้สูตร:
P = I²R,
โดย:

• P คือ การสูญเสียจากทองแดงในหน่วยวัตต์ (W),

• I คือ กระแสที่ไหลผ่านขดลวดในหน่วยแอมแปร์ (A),

• R คือ ความต้านทานของขดลวดในหน่วยโอห์ม (Ω).

เนื่องจากขดลวดที่ใช้ร่วมกันแบกรับกระแสรวม (ผลรวมของกระแสโหลดหลักและรอง) กระแสทั้งหมดในส่วนที่แบ่งปันจึงสูงขึ้น แต่เนื่องจากการออกแบบและการแปลงแรงดันของออโต้ทรานส์ฟอร์มเมอร์ การสูญเสียจากทองแดงจริงๆ แล้วมักจะ น้อยลง มากกว่าในทรานส์ฟอร์มเมอร์สองขดลวดที่เทียบเท่า เพราะมีกระแสที่ไหลผ่านบางส่วนของขดลวดน้อยลง และความยาวของตัวนำทั้งหมดลดลง

อย่างไรก็ตาม การลดการสูญเสียจากทองแดงยังคงเป็นเป้าหมายสำคัญในการออกแบบ ซึ่งสามารถทำได้โดยใช้ตัวนำที่มีความต้านทานต่ำและการปรับปรุงการออกแบบขดลวด การระบายความร้อนอย่างมีประสิทธิภาพเป็นสิ่งจำเป็นเพื่อให้แน่ใจว่าทรานส์ฟอร์มเมอร์ทำงานอยู่ภายในอุณหภูมิที่ปลอดภัย