Балықтың же токтың квадраты мен өзгерткіштің сопротивлениясының көбейтіндісі арқылы пайда болатын жасыл түсті жою (I²R жою) автотрансформерде да, басқа түрлердің трансформерлерінде сияқты, орын аледі. Бұл жою, виткеліктегі мешін өзгерткіштердің сопротивлениясына байланысты пайда болады. Ағыс виткелікке өткенде, электр энергиясы өзгерткіштердің сопротивлениясына байланысты жылуға айналады.
Автотрансформерде, бір виткелікті екі функция үшін - негізгі және көмекші үшін қолдану арқылы, мешін жою да қалыптасады. Мешін жою мына формуламен есептеледі:
P = I²R,
мұнда:
P - мешін жою, ватта (W),
I - виткелікке өтуі мүмкін болатын ағыс, амперда (A),
R - виткеліктің сопротивлениясы, омда (Ω).
Ескертуілетін виткелік, негізгі және көмекші жүк ағыстарының қосындысын өткізетінімен, бөлік бөлігіндегі жалпы ағыс деңгейі жоғары. Бірақ, автотрансформердің конструкциясы мен напряжение түрлендіру принципіне байланысты, нақты мешін жою, эквивалент екі виткелік трансформерге қарағанда, ағыс өзгерген виткеліктің бөлігінен өтуі мен жалпы проводник ұзындығының азайтуына байланысты, көбінесе төмен болады, жоғары емес.
Олай болса, мешін жоюны минималдау әлі де маңызды конструкторлық максат болып табылады. Бұл, төмен сопротивлениялы проводниктерді қолдану арқылы және виткелік дизайнін оптимизациялау арқылы жасалады. Трансформердің иесінде жылу жоюының әсерін жою үшін, тиімді жылу жоюы маңызды.