ความผิดปกติในหม้อแปลงไฟฟ้ามักเกิดจากการทำงานที่โหลดสูงเกินไป การลัดวงจรเนื่องจากการเสื่อมสภาพของฉนวนขดลวด การเสื่อมสภาพของน้ำมันหม้อแปลง ความต้านทานการติดต่อสูงเกินไปที่จุดเชื่อมต่อหรือสวิตช์เปลี่ยนระดับแรงดัน การทำงานผิดพลาดของฟิวส์แรงดันสูงหรือต่ำระหว่างการลัดวงจรภายนอก การเสียหายของแกนกลาง การอาร์คไฟภายในน้ำมัน และการถูกฟ้าผ่า
เนื่องจากหม้อแปลงเต็มไปด้วยน้ำมันฉนวน ไฟไหม้สามารถมีผลร้ายแรงได้ ตั้งแต่การพุ่งกระจายและการเผาไหม้น้ำมัน จนถึงกรณีที่รุนแรงมากที่สุด คือ การสร้างก๊าซอย่างรวดเร็วจากการสลายตัวของน้ำมัน ทำให้แรงดันภายในถังเพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็ว จนถึงขั้นแตกของถัง น้ำมันรั่วไหลออกเป็นจำนวนมาก และการเผาไหม้อย่างรุนแรง
มาตรการป้องกันประกอบด้วย:
(1) ติดตั้งฟิวส์หรืออุปกรณ์ป้องกันโดยใช้เครื่องตรวจจับสำหรับหม้อแปลง สำหรับหม้อแปลงขนาดใหญ่ควรติดตั้งรีเลย์แก๊ส (Buchholz) เพื่อแยกหม้อแปลงที่เสียหายออกจากสายส่งไฟฟ้าอย่างรวดเร็ว
(2) เสริมการตรวจสอบฉนวนโดยการทดสอบฉนวนป้องกันประจำและบำรุงรักษาระยะเวลาหรือสลับการซ่อมแซม
(3) จัดการน้ำมันฉนวนอย่างเหมาะสม: หากตรวจพบว่าน้ำมันเสื่อมสภาพ มีความชื้นเข้าไป หรือค่าความต้านทานไฟฟ้าลดลง ควรกรองหรือเปลี่ยนด้วยน้ำมันใหม่ที่มีคุณภาพ
(4) ติดตั้งหม้อแปลงภายนอกอาคารหรือภายในอาคารที่มีอัตราการทนไฟระดับ I หรือ II โดยต้องมั่นใจว่ามีระบบระบายอากาศที่เหมาะสม
(5) เสริมการจัดการการปฏิบัติงานโดยตรวจสอบการโหลดหม้อแปลงในช่วงเวลาที่มีโหลดสูง หากตรวจพบว่าโหลดเกินควรกระจายโหลดหรือเปลี่ยนเป็นหม้อแปลงที่มีกำลังมากกว่า
(6) ตรวจสอบการดำเนินงานของอุปกรณ์ป้องกันฟ้าผ่าอย่างสม่ำเสมอและเปลี่ยนอุปกรณ์ที่ชำรุดทันท่วงที
(7) ส่งเสริมการใช้หม้อแปลงไฟฟ้าแบบปิดสนิท สำหรับอาคารสูงและสถานที่สำคัญอื่น ๆ ควรเลือกใช้หม้อแปลงแบบแห้งที่ป้องกันไฟหรือดับเองเองหรือหน่วยที่เตรียมไว้ (pad-mounted)