Voimanmuuntajan tehokkuus riippuu monista tekijöistä, kuten sen suunnitelmasta, koko ja toimintatilanteista. Yleisesti ottaen voimanmuuntajat ovat erittäin tehokkaita, tyypillisillä tehokkuuksilla yli 95 %, usein saavuttaen 98 % tai enemmän. Kuitenkin todellinen tehokkuus voi vaihdella lataustason, jännitteiden arvosten ja tiettyjen suunnittelun ominaispiirteiden mukaan.
Muuntajan tehokkuus (η) määritellään ulostuloenergian ja sisääntuloenergian suhteena, ilmaistuna prosentteina:
η = (Ulostulo / Sisääntulo) × 100%
Useat avaintekijät vaikuttavat muuntajan tehokkuuteen:
Lataustaso: Muuntajat saavuttavat huipputehokkuuden yleensä toimiessaan lähellä niiden valmistajan antamaa latausta. Tehokkuus laskee sekä hyvin kevyillä latauksilla (vuoksi kiinteitä magneettiytimen häviöitä) että raskaissa ylilatauksissa (vuoksi lisääntyneitä kuparihäviöitä).
Ytimen ja kuparin häviöt:
Ytimen häviöt (jotka koostuvat hystereesihäviöistä ja pyörivien virrannoiden häviöistä) tapahtuvat magneettityrmässä ja ne ovat läsnä aina, kun muuntaja on sähköitetty, jopa nollalatauksessa.
Kuparihäviöt (I²R-häviöt) tapahtuvat kytkentäjohtoissa johtojen sähköisen vastuksen vuoksi ja ne vaihtelevat ladattujen virta-nykyjen neliön mukaan.

Jännite: Korkeamman jännitteen muuntajat yleensä näyttävät parempaa tehokkuutta. Korkeampi jännite vähentää annetulla teholuokituksella kulkevaa virtaa, mikä minimoi kytkentäjohtojen kuparihäviöt.
Muuntajan suunnittelu: Suunnittelupäätökset, kuten ytimen materiaali (esimerkiksi siilihieriste), johtomateriaali (kupari vs. alumiini), kytkennän konfiguraatio ja jähdytysmenetelmä (ONAN, ONAF jne.), vaikuttavat merkittävästi kokonaistehokkuuteen.
Toimintalämpötila: Muuntajat on suunniteltu toimimaan tietyssä lämpötilavälissä. Ylittäessään nämä rajat eristyksen ikääntyminen nopeutuu ja vastushäviöt kasvavat, mikä vaikuttaa negatiivisesti tehokkuuteen ja pituudelle.
On tärkeää ymmärtää, että muuntajissa tapahtuvat energiahäviöt ovat luonteeltaan olemassaolevia ja ne luokitellaan kahteen pääluokkaan: nollalataushäviöt (pääasiassa ytimenhäviöt) ja latausriippuvaiset häviöt (pääasiassa kuparihäviöt). Vaikka valmistajat jatkuvasti optimoivat suunnitelmiaan häviöiden minimointiin, muuntajat eivät voi saavuttaa 100 % tehokkuutta, sillä osa energiasta hukataan väistämättä lämpönä.
Tehokkuusstandardit ja asetusvaatimukset vaihtelevat alueen ja sovelluksen mukaan (esim. DOE Yhdysvalloissa, IEC-standardit kansainvälisesti). Valittaessa muuntajaa on olennaista arvioida odotettuja latausprofiileja, toimintatilanteita ja sovellettavia tehokkuusstandardeja varmistaakseen optimaalisen suorituskyvyn, energiansäästön ja pitkäaikaisen luotettavuuden sähköjärjestelmässä.