Red sekvenca isključivanja glavnog transformatora je sledeća: prilikom deenergizacije, najpre se isključuje strana sa opterećenjem, zatim strana sa snabdevanjem. Za operacije energizacije, primenjuje se obrnut redosled: najpre se energizuje strana sa snabdevanjem, zatim strana sa opterećenjem. To je zato što:
Energizacija od strane sa snabdevanjem prema strani sa opterećenjem olakšava identifikaciju opsega greške i poduzimanje brzih odluka i mera u slučaju greške, sprečavajući širenje ili proširenje greške.
U scenarijima sa više izvora snabdevanja, isključivanje strane sa opterećenjem prvo može sprečiti obrtanu punjenju transformatora. Ako se prvo isključi strana sa snabdevanjem, greška može dovesti do nepravilnog funkcionisanja zaštitnih uređaja ili njihovog neuspeha, produžujući vreme otklanjanja greške i potencijalno proširujući opseg greške.
Kada se na bus strane sa opterećenjem nalazi transformator napona sa uređajem smanjenja opterećenja pri niskoj frekvenciji bez blokade struje, isključivanje prekidača strane sa snabdevanjem prvo može dovesti do lažnog delovanja uređaja smanjenja opterećenja zbog povratne veze velikih sinkronih motora.